PESQUISA EM ANDAMENTO

Coordenadora: Profª. Drª. Maria Luiza Almeida Campos
 

Financiamento/Cooperação: CNPq e UFF

Identificação/Descrição:

As pesquisas em Bioinformática no Brasil vêm desenvolvendo estudos para prover um ambiente que possa oferecer informação semântica sobre  recursos científicos e possibilitar o uso destes recursos de forma conjunta pela comunidade científica interessada, através de consórcios entre instituições de pesquisa.Um dos aspectos que envolvem a descrição e recuperação destes recursos e serviços está relacionado ao desenvolvimento de uma linguagem padronizada para facilitar o entendimento dos vocabulários, muitas vezes interdisciplinares. Este projeto de pesquisa propõe investigar mecanismos de uso, desenvolvimento e integração de Ontologias a partir das bases teóricas da Ciência da Informação e da Terminologia, que permitam a descrição e recuperação dos recursos e serviços de Bioinformática, especificamente no domínio de Genoma e Transcriptoma, visando apoiar as pesquisas nesta área no Brasil. Uma ontologia é um conjunto de conceitos padronizados, termos e definições aceitas por uma comunidade particular. Dentro do domínio de desenvolvimento de Ontologias, as abordagens para a sua construção, na maioria das vezes,  são específicas e limitadas. A literatura, no âmbito da Ciência da Computação, tem privilegiado ora as ontologias como vocabulários de domínios específicos, sem um suporte teórico, ora um conjunto de regras e aportes teóricos, sem elementos que orientem a elaboração de vocabulários axiomatizados. Além disto, verifica-se a existência de dois grandes problemas nas metodologias para projeto de ontologia: a falta de explicação sistemática de como e onde serão usadas as abordagens teóricas dentro de seu processo de elaboração; a não existência dos estágios de integração e manutenção de ontologia no método na maioria das metodologias.Acredita-se que o aporte teórico  e metodológico existente no âmbito da Ciência da Informação se beneficiando de estudos no escopo da Teoria da Terminologia, Teoria do Conceito, Teoria da Classificação e Compatibilização de Linguagens possa apresentar propostas eficazes de aplicação. Dentro desta especificidade propõe quatro eixos de ações: 1. Identificar  as bases teóricas da Ciência da Informação e da Terminologia, no campo específico de construção e compatibilização de ontologias,  visando o compartilhamento e recuperação de informação; 2. Identificar as Ontologias do domínio de Genoma e Transcriptoma existentes internacionalmente e nacionalmente; 3. Identificar no Consórcio Internacional que aspectos do projeto não estão sendo contemplados nas diversas ontologias analisadas, visando atender as especificidades brasileiras; 4. Para os domínios de Genoma e Transcriptma não atendidos nos consórcios investigados, propor a modelização para o desenvolvimento deste domínio. O caminho metodológico apresentado se apóia em dois campos de investigação: o campo empírico e o campo teórico. O campo empírico pretende uma análise conceitual do campo de Genoma e Transcriptoma, assim como das ontologias existentes e que possam abarcar este domínio. No âmbito do campo teórico, e para apoiar as análises qualitativas que advém da investigação do campo empírico, será necessário um estudo comparativo entre as teorias apresentadas, visando apresentar eixos de investigação para a definição de diretrizes dos dois produtos que se espera com esta investigação, ou seja: diretrizes para a compatibilização de ontologias e diretrizes para a elaboração de ontologias de domínios. Como alguns dos resultados esperados do projeto podemos citar: diretrizes para integração de ontologias; diretrizes para o desenvolvimento de ontologias; modelização do domínio de Genoma e Transcriptoma; tutorial para integração de ontologias. Espera-se que este projeto venha possibilitar maior integração das informações criando mecanismos para consolidar a participação do Brasil nos consórcios internacionais que envolvem a pesquisa em Genoma e Transcriptoma.